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腸道間質(zhì)瘤的治療方法有多種，要根據(jù)病人的狀況、間質(zhì)瘤分期選擇不同的治療方法，包括手術(shù)治療、化療、藥物治療。

如果間質(zhì)瘤長在小腸，進行小腸切除。如果間質(zhì)瘤長在大腸，則為大腸部分切除，切除目的是盡量達到根治。如果腸道間質(zhì)瘤進展到晚期，或者已經(jīng)有遠處轉(zhuǎn)移，出現(xiàn)肝轉(zhuǎn)移或腹腔轉(zhuǎn)移，此時不能進行根治性切除，可以進行姑息手術(shù)。術(shù)后依賴藥物治療，如伊馬替尼等。