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小兒腹瀉的原因可歸納為非感染性與感染性。常見非感染性原因主要有：
1、小兒消化系統(tǒng)發(fā)育不成熟，胃酸和消化酶分泌少，消化酶活性低，承受不了食物中質(zhì)和量的較大變化；
2、飲食不當(dāng)或喂養(yǎng)不當(dāng)均可以引起腹瀉，夏天給小兒斷奶或者突然改變飲食內(nèi)容等都可以造成腹瀉；
3、氣候變化比如受涼可以引起胃腸功能紊亂，腸蠕動(dòng)增加引起腹瀉，氣候炎熱和穿著過多可使胃酸及消化酶分泌減少導(dǎo)致消化不良引起腹瀉；
4、食物過敏，如果父母有相關(guān)食物的過敏史，應(yīng)避免兒童進(jìn)食此類食物，如果進(jìn)食可能出現(xiàn)除皮疹以外的消化系統(tǒng)癥狀如腹痛、腹瀉，嘔吐等；
5、嬰兒期頑固性腹瀉，應(yīng)警惕代謝性疾病如先天性甲狀腺功能亢進(jìn)等；
6、炎癥性腸病包括潰瘍性結(jié)腸炎和克隆恩氏病。
感染因素主要有腸道內(nèi)的感染如細(xì)菌、病毒、寄生蟲等隨食物進(jìn)入消化道進(jìn)行繁殖，引起消化道感染，出現(xiàn)腹瀉；腸道外的感染，小兒患有肺炎、上呼吸道感染、胃炎等疾病時(shí)受病原體毒素影響，使消化液分泌減少，腸蠕動(dòng)增強(qiáng)而導(dǎo)致腹瀉。長(zhǎng)期使用抗生素導(dǎo)致菌群失調(diào)，破壞了腸道正常菌群，也可以引起腹瀉。