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靶向藥物治療脊索瘤目前仍處在研究階段，目前有研究表明，對于血小板源性生長因子受體α和β陽性的脊索瘤病人，在使用伊馬替尼治療6個(gè)月之后進(jìn)行隨訪，發(fā)現(xiàn)84%的病人腫瘤不再進(jìn)展，16%的病人腫瘤縮小，也就是說靶向藥物治療脊索瘤可能具有一定的作用，但是需要根據(jù)其分型而定。
對于脊索瘤的主要治療，還是以廣泛手術(shù)全切聯(lián)合放射治療為主。因?yàn)榧顾髁稣w預(yù)后不是特別好，不管采用哪種治療方法，總是不能得到讓人滿意的效果，但是，如果不治療，預(yù)后肯定是更差的。